Sztandar jest jednym z najważniejszych symboli naszej placówki, który uczestniczy we wszystkich najważniejszych uroczystościach szkolnych oraz państwowych i religijnych. Inicjatorem pozyskania nowego sztandaru dla Zespołu Szkół w Kwilczu, w skład którego wchodziły Szkoła Podstawowa im. Tadeusza Kościuszki i Gimnazjum im. Tadeusza Kościuszki, była opiekunka pocztu Olga Lehmann. Inicjatywa podjęta w 2015 r. znalazła zrozumienie i poparcie u wójta Stanisława Mannka i ówczesnego przewodniczącego Rady Rodziców Waldemara Rymarskiego. Na spotkaniu grupy roboczej w składzie: Olga Lehmann, Katarzyna Paczyńska, Jolanta Milka, Marcin Lehmann i Waldemar Rymarski ustalono, że projekt przygotuje nauczycielka plastyki Jolanta Milka, przy konsultacji historycznej Marcina Lehmanna, a pozostałe osoby dokonają wyboru wykonawcy sztandaru. Po rozpatrzeniu kilku ofert, jednomyślnie zdecydowano, że realizacja projektu zostanie powierzona Grażynie Olejnik z Lubosza. Początkowo termin nadania nowego sztandaru ustalono na Dzień Patrona 2016 r., tuż po 270. rocznicy urodzin wodza insurekcji. Jednak ze względu na zapowiedź reformy oświaty i likwidację gimnazjów, postanowiono wstrzymać wykonanie sztandaru. Ostatecznie nadanie szkole nowego sztandaru odbyło się w piątek 13 października 2017 r. podczas akademii z okazji Dnia Edukacji Narodowej. Wyjątkowości wydarzeniu dodawał fakt, że uroczystość odbyła się w przeddzień 200. rocznicy śmierci Naczelnika, z okazji której polski parlament ustanowił rok 2017 – Rokiem Tadeusza Kościuszki. W tym czasie w naszej szkole zorganizowano wiele ciekawych inicjatyw. W pierwszej połowie roku przypadły również dwie ważne dla społeczności szkolnej rocznice: 28 lutego – 10. rocznica nadania imienia Gimnazjum, a 12 maja – 50. rocznica nadania imienia Szkole Podstawowej.

Awers, czyli główna strona sztandaru jest koloru czerwonego. Na tym tle umieszczone jest godło państwowe – srebrny orzeł z głową ozdobioną złotą koroną zwróconą w prawo. Dookoła słowa: OJCZYZNA, NAUKA, TOLERANCJA, PRACA. U dołu data 2017 i herb gminy Kwilcz. Rewers jest koloru brązowego. Na tym tle umieszczone są symbole związane z Patronem szkoły, tj. czapka kosynierów „krakuska” i szabla „kościuszkówka” z końca XVIII w., opleciona wstęgą ze słowami: WOLNOŚĆ, RÓWNOŚĆ, BRATERSTWO. Dookoła nazwa: SZKOŁA PODSTAWOWA im. Tadeusza Kościuszki W KWILCZU. Sztandar ma kształt kwadratu o wymiarach 100x100 cm, obszyty jest złotymi frędzlami, drzewce o wysokości 250 cm zwieńczone jest okuciem z metalowym srebrnym orłem, a dolna część zakończona jest metalowym trzewikiem. Na sztandarze znajdują się odznaczenia, którymi została wyróżniona szkoła: „Złoty Medal Opiekuna Miejsc Pamięci Narodowej”, „Odznaka Honorowa Sybiraka” i „Odznaka Za Zasługi dla Związku Kombatantów RP i Byłych Więźniów Politycznych.” Na drzewcach umieszczono trzy gwoździe. Dwa upamiętniają fundatorów, czyli Gminę Kwilcz i Radę Rodziców, a trzeci to gwóźdź nadania sztandaru o następującej treści: „Sztandar Szkoły Podstawowej im. Tadeusza Kościuszki w Kwilczu, ufundowany w roku 50-tej rocznicy nadania jej imienia oraz w ramach obchodów Roku Tadeusza Kościuszki. Poświęcony i przekazany szkole 13 października 2017.” Symbolicznego umocowania pamiątkowych gwoździ, dokonali wójt Stanisław Mannek, przewodnicząca Rady Rodziców Agata Ceglarek i dyrektor szkoły Jacek Rosiak. Po poświęceniu nowego sztandaru przez miejscowego proboszcza ks. Jana Kasztelana, fundatorzy przekazali go dyrektorowi szkoły. Uczniami wchodzącymi w skład pocztu byli gimnazjaliści: chorąży Piotr Przybyła w asyście Julii Piechockiej i Marceliny Piotrowicz.

Akademia z okazji Dnia Edukacji Narodowej 13 października 2017 r., podczas której nadano szkole nowy sztandar. Na zdjęciu wójt Stanisław Mannek, przewodniczaca Rady Rodziców Agata Ceglarek i dyrektor Jacek Rosiak.